SSSS.Dynazenon หลังเลิกเรียนหนึ่งวัน โยโมกิ อาซานากะ นักเรียนมัธยมปลายปีแรกได้พบกับชายคนหนึ่งที่อดอยากอยู่ใต้สะพาน แนะนำตัวเองในชื่อ Gauma นักเร่ร่อนแปลก ๆ บอก Yomogi ว่าเขาคือ “ผู้ใช้ไคจู” บุคคลที่จัดการกับ “ไคจู” ซึ่งเป็นสัตว์ประหลาดที่นำอันตรายมาสู่เมืองและพลเมือง

เย็นวันถัดมา โยโมกิได้พบกับเกามะและยูเมะ มินามิ เพื่อนร่วมชั้นของเขา ในเวลาเดียวกัน ไคจูปรากฏขึ้นในพื้นที่ที่มีประชากรมากมายของเมือง เนื่องจาก Gauma ขาดประสบการณ์ในการควบคุม Kaiju เขาจึงนำวัตถุลึกลับออกมาจากกระเป๋าเรืองแสง เรียกหุ่นยนต์ยักษ์ที่รู้จักกันในชื่อ Dynazenon โดยต้องใช้ความร่วมมือจากคนสี่คน รถจักรกลลาก Gauma, Yomogi, Minami และ Koyomi Yamanaka ซึ่งเป็นชายว่างงานซึ่งกำลังเร่ร่อนอยู่บนถนนเข้าไปในห้องนักบิน

การเผชิญหน้าของพวกเขากับไคจูเป็นจุดเริ่มต้นของการพัวพันกับนักสุพันธุศาสตร์ไคจู ซึ่งเป็นผู้ใช้ไคจูที่จัดการกับไคจูด้วยเจตนาร้าย และความพยายามของพวกเขาในการดึงศักยภาพของไดนาเซนอนออกมาอย่างเต็มที่